帮派迷宫的挑战模式相比普通模式更考验团队协作和策略规划。首先在开启条件上，挑战模式需要帮派等级达到3级，并且由迷宫之主在活动前一天19:00至当天19:00申请开启，普通模式则没有时间限制。挑战模式的怪物难度更高，比如秽气妖和劳释道人的血量与伤害显著提升，需要队伍配置更合理的输出与辅助组合。挑战模式的奖励也更丰厚，包括高兽决、附魔宝珠和灵饰书铁等稀有物品，吸引更多玩家参与。
挑战模式的核心玩法分为多个阶段，每个阶段都有独特机制。第一阶段需要击杀4个入侵者获取100点信任度，之后进入秽气巢林击杀10个秽气妖。这里要注意帮派频道的提示，如果出现受伤的树精，可以优先帮它找内丹，获得额外钥匙奖励。第二阶段需要破解天地人三才阵法，主怪伤害较高且会复活，建议优先集火主怪并配合其他队伍击杀阵眼。挑战模式的阵眼刷新更快，需要更高效的沟通与执行。
在无源之水场景中，上古化蛇分为金龙和银龙，金龙需要撑过10回合，银龙则需在10回合内击杀。这两场战斗的奖励更优，但难度较大，建议队伍提前调整好状态。五彩宝箱环节的刷新时间更紧凑，通常在9:40左右出现，需要快速反应才能抢到。挑战模式还增加了梦莲子任务，散队领取坐标后组队播种，完成6个可获得金钥匙，这是普通模式没有的玩法。
