作为一款三国题材的策略卡牌游戏，少年三国志零在玩法设计和养成系统上存在一些明显的不足。游戏的核心问题在于武将获取和培养体系对非付费玩家不够友好，高资质武将如黄忠、太史慈等几乎只能通过充值获取，而卡池抽奖机制的心愿系统需要累计500抽才能解锁，这使得零氪玩家在前期难以组建理想阵容。红将系统更是将付费门槛拉高，三星红将保底需要45000-50000元宝，四星则需要72000元宝外加648元充值，六星红将的获取成本甚至高达万元，这种设计直接导致平民玩家与氪金玩家的战力差距悬殊。
游戏中的红宝物和红武魂系统进一步放大了付费差异。红宝物虽可通过寻宝兑换获取，但最高只能获得金色品质，红色品质基本属于氪金专属。而红武魂的随机获取机制则更为苛刻，不仅没有任选途径，其属性直接决定兵种培养方向，抽到不匹配的红武魂会严重影响阵容强度。这种完全依赖运气的设计让不少玩家感到挫败，即使是高V玩家也经常因为抽不到理想武魂而影响游戏体验。资源分配的不平衡使得玩家在中期就容易陷入养成瓶颈，难以通过策略弥补战力差距。
新区开服时经常出现大量小号占城的情况，这严重影响了新玩家的生存空间。而玩家活跃度下降速度较快，通常开区一周后就只剩下几个大团保持活跃，一个月后多数服务器会沦为单机状态。跨服活动中小号占优的现象长期存在，官方却未能有效解决这个问题，导致新老玩家之间的竞争环境失衡。游戏福利相对单薄，日常奖励以银两和经验为主，稀有资源获取途径有限，这也加速了玩家的流失。
从玩法深度来看，虽然游戏强调策略布阵和兵种搭配，但后期内容重复度较高。日常任务设计较为基础，主要以刷副本和收集资源为主，缺乏足够的挑战性和变化。赤壁之战、九州争霸等核心玩法虽然需要多阵容搭配，但受限于武将培养难度，平民玩家往往只能固定使用某几种流派。军师系统的计谋组合本该增加战斗变数，但在实际对战中，数值压制往往比策略运用更关键，这在一定程度上削弱了游戏的策略性。
游戏的养成节奏把控也存在优化空间。前期的快速成长阶段与中后期的资源瓶颈形成鲜明对比，玩家很容易在某个阶段突然感到进度停滞。武将升星碎片获取缓慢，特别是16资质武将每天只能刷8碎片，将一个小乔从零培养到六星需要极其漫长的周期。这种陡峭的养成曲线让不少玩家在中期就失去持续投入的动力，转而进入收菜模式。虽然这类卡牌游戏本就以长线养成为主，但阶段间的平滑过渡显然需要更好设计。
少年三国志零在战斗系统和三国题材还原上确有亮点，但付费设计过于倾向重氪玩家，资源获取和武将培养体系对平民不够友好，社交生态和后期玩法也有待完善。这些结构性问题的存在，使得游戏更适合愿意长期投入的付费玩家，而对追求平衡体验的普通玩家来说挑战较大。开发者需要在保持商业化的同时，更多考虑不同层次玩家的游戏体验平衡。
